从小规模纳税人购进农产品取得增值税专用发票计算抵扣进项税额时是否含增值税?

答：根据《财政部国家税务总局关于简并增值税税率有关政策的通知》（财税[2017]37号）及其他规定，二、纳税人从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额。

所以是按发票上的不含税金额计算抵扣进项税。